山西醫(yī)藥職業(yè)學院設有中醫(yī)系、制藥工程系、藥學系、工商管理系、儀器工程系、食品工程系等系，以下是具體名單，以供參考，可調整的，以學校最新公告為準。

1、教學部

中醫(yī)系

制藥工程系

藥學系

工商管理系

儀器工程系

食品工程系

基礎部

公共體育系

繼續(xù)教育部

思想政治理論課教研室

2、山西醫(yī)藥職業(yè)學院簡介

山西醫(yī)藥職業(yè)學院，位于山西省太原市，經(jīng)山西省人民政府批準、經(jīng)教育部注冊的藥學一級高等職業(yè)技術學院，山西省食品藥品監(jiān)督管理局。山西醫(yī)藥職業(yè)學院，成立于1957年，原中專制山西中醫(yī)藥學校，2001年4月，升格為山西生物應用職業(yè)技術學院，2012年2月，更名為山西醫(yī)藥職業(yè)學院。2015年入選首批國家現(xiàn)代學徒制試點單位。